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Calificaciones Biotecnología 1 (Teoría)

Estimad@s tod@s,   Aquí las calificaciones hasta el momento del curso de biotecnología. Estas calificaciones son para la parte de teoría (biología), son la calificación de mi sección (cs. de la tierra). La calificación final del curso estará publicada en este sitio a finales de la próxima semana con la calificación del laboratorio (biología). Para…
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Examen de reposición 2017-1 Biotecnología

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Trabajo final de Biotecnología (2017-1)

Reglas: Se debe de hacer un ensayo sobre alguno de los siguientes temas: Edición de genomas Terapia génica Biotecnología agrícola Biotecnología industrial Genómica Biología sintética Desarrollo de vacunas Se hace por equipos de 2-3 personas, no se aceptan trabajos individuales. Se debe de hacer bajo la siguiente estructura: Introducción sobre el problema debidamente fundamentada y referenciada…
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2017-1 Biotecnologia última tarea

Hacer un control de lectura y tu opinión de las siguientes lecturas: http://elpaissemanal.elpais.com/documentos/transgenicos/ http://elpais.com/elpais/2016/06/30/ciencia/1467286843_458675.html Con la información de la clase haz un control de lectura y emite tu opinión (libremente) de lo que opinas de los riesgos/beneficios de la biotecnología agrícola. ¿Cambió tu percepción de esto en el curso? Loading…

Buscando patrones de evolución genómica en arqueas

Wolf y compañía evaluaron un modelo de evolución genómica basándose en un conjunto de principios dados por comparaciones de genomas procariontes: 1- existe un número muy reducido de genes universales, 2- del 10 al 30% de los genes en la mayoría de los genomas microbianos son ORFan (presentes en pocas especies emparentadas), 3- los genes…
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Relación entre la distancia genética de plantas hospederas y su microbioma de rizósfera

Hospederos de un mismo grupo taxonómico comparten características que pueden determinar la selección de microorganismos asociados al condicionar las propiedades como la superficie de colonización, disponibilidad de carbono y fuentes de energía o la exposición a mecanismos de defensa y  metabolitos secundarios. La hipótesis de este trabajo es que la historia evolutiva de hospederos puede…
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Anotación funcional genómica rápida a través de asignación de ortología con eggNOG-mapper

La identificación de los genes originados por especiación, conocidos como genes ortólogos, es una pregunta central en biología evolutiva. La teoría dice que la retención de funciones ancestrales es más probable entre genes ortólogos que entre parálogos. En este artículo, Huerta-Cepas et al. Describen una herramienta que utiliza la base de datos de ortólogos ‘eggNOG’…
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Comunidades microbianas artificiales contra la invasión de patógenos

Este trabajo utiliza experimentos de microcosmos y de jardín común para analizar el efecto que tienen las comunidades previamente establecidas en un hospedero ante la llegada de un patógeno. Con éste fin, se utilizaron cinco bacterias del género Ralstonia sin capacidad infectiva, establecidas en placas microtituladoras y raíz de tomate, que posteriormente fueron sujetas a…
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Actualización calificaciones Biotecnología

En los próximos días estarán disponibles las calificaciones de tareas

Combinando buscadores de ortólogos con aprendizaje automático

Conocer las proteínas funcionalmente equivalentes entre dos organismos es un tema interesante tanto para la biología evolutiva como para la investigación biomédica, sin embargo esta no es una tarea trivial. Una estrategia relativamente robusta para comenzar, consiste en identificar los genes ortólogos (genes derivados de un ancestro a partir de un evento de especiación) con…
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Utilizando metales en bacterias: selenio

El Selenio (Se) se utiliza como micronutriente en muchos organismos, en pequeñas dosis, se conoce su papel en la homeostasis redox. Se utiliza inclusive cómo agente preventivo en quimioterapias. Hay tres formas biológicas de Se: Selenocisteina (Sec); 5 metilaminometil 2-selenouridina (mnm5SE2U o SeU) y; en forma de cofactor (Se-cofactor) utilizado en enzimas de procariontes que…
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Colonización artificial del intestino de ratón

Con el objetivo de estudiar el potencial de las bacterias para colonizar ambientes diferentes al propio, se tomaron inóculos de diversas fuentes (intestinos humanos, de pez cebra y termita; piel y lengua humana; tapetes microbianos y suelo), y se introdujeron mediante la dieta en intestinos de ratón libres de gérmenes. El experimento, que se llevó…
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Comparando manzanas y naranjas? Secuenciación de alto rendimiento y su impacto en los análisis de microbioma

La secuenciación de alto redimiendo consta múltiples protocolos. Para cada uno de estos se han desarrollado varias metodologías, lo cual puede significar que los resultados de un estudio no puedan ser comparables con los de otro. En este paper comparan el impacto de estas metodologías en las misma data. Observan que el factor con el…
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