Categoría: journal club

Arbustos y árboles favorecen la diversidad bacteriana en jales mineros

Los jales mineros abandonados representan un sustrato considerado tóxico ya que contienen contaminantes como arsénico o sales ricas en metales pesados. A pesar de esto, se ha observado que algunas plantas son capaces de crecer en estos ambientes, lo cual representa un caso de sucesión primaria. Estas plantas mejoran la estructura del suelo y su…
Leer más

Análisis de la diversidad microbiana y búsqueda de nuevas enzimas con actividad de xilanasas en sedimentos de aguas termales en España.

Los xilanos son el segundo grupo más abundante de polisacáridos en la naturaleza, forman parte de la pared celular de las plantas.  Las enzimas xilanasas, catalizan la ruptura de los xilanos. Estas enzimas se encuentran presentes en bacterias, plantas e insectos. Además, se ha encontrado que existen otras enzimas como las glicósido hidrolasas (GH) que…
Leer más

La supresión de patógenos es mediada por la competencia por hierro en suelos.

Un problema grave en la agricultura es la infección por patógenos del suelo. Se sabe que distintos microorganismos presentes en los microbiomas de las plantas pueden conferir un efecto de protección contra algunos de estos agentes mediante la correlación de la estructura del microbioma con el estado de salud de las plantas o al probar…
Leer más

Descubriendo el potencial de la metagenómica a través de distintos diseños experimentales

Los primeros trabajos de metagenómica enfocados a estructura y función de comunidades microbianas de distintos ambientes dieron indicios del potencial de esta tecnología para detectar genes funcionales, interacciones y filotipos que no habían sido descritos. Sin embargo, con el paso del tiempo se han identificado desventajas, entre las que se encuentran la escasez y estandarización…
Leer más

Las vías de absorción de hierro más importantes en el medio marino

El hierro es un micronutriente poco disponible en el ambiente pelágico, ya que la mayor parte de este elemento en el agua de mar está fuertemente unido por ligandos orgánicos o secuestrado por óxidos minerales. Es por ello que se han realizado diferentes investigaciones acerca de las capacidades de adquisición de hierrro de las bacterias…
Leer más

Diferencias en el microbioma de rizosfera dependiendo de un sistema de manejo con y sin labranza

La heterogeneidad espacial del suelo puede generar diferencias en el microbioma del mismo dependiendo del micronicho analizado, como el suelo circundante, la rizosfera, o detritosfera debido a sus propiedades fisicoquímicas particulares generadas por la presencia o ausencia de raíces de plantas así como el estado fisiológico de las mismas. Los suelos con labranza y sin…
Leer más

Delimitando especies bacterianas con base en la taxonomía genómica

La base de datos de taxonomía genómica (GTDB, por sus siglas en inglés) es un esfuerzo de clasificación taxonómica para más de 150,000 organismos de los dominios Bacteria y Archaea (incluyendo genomas de oganismos no cultivables ensamblados a partir de secuencias metagenómicas). Este sistema se basa en las relaciones filogenéticas de las secuencias genómicas de…
Leer más

Perspectivas en la incorporación de nuevas tecnologías para el mejoramiento de cultivos con base en la microbiota asociada a la raíz

Considerando las problemáticas generadas por el cambio climático, la degradación de los ecosistemas y la creciente de manda de alimentos, los autores del presente trabajo sugieren una serie de metodologías que prodían resultar en el mejoramiento de los cultivos por medio de la selección de la microbiota asociada a las plantas. Esta selección de comunidades…
Leer más

Buscando el curso de la transferencia de un operón bacteriano a un organismo eucarionte

Los operones son una característica distintiva de los genomas bacterianos que permiten la expresión en conjunto de genes relacionados funcionalmente; sin embargo, ante diferentes ejemplos de operones eucariotas (que son raros) se ha propuesto que su diseminación haya sido posiblemente mediante un proceso de transferencia horizontal (HGT) que podría haber permitido la propagación rápida de…
Leer más

El microbioma de rizósfera influye en la exudación de metabolitos

En este trabajo los autores es enfocan en dilucidar si la microbiota afecta a exudados de raíz de Solanum lycopersicum sin darle un enfoque basado en resistencia a patógenos o a algún tipo de estrés, que es el que se le ha dado en la mayor parte de los estudios realizados. Plántulas de 14 días…
Leer más

Efectos de la domesticación en la arquitectura de raíz de plantas de trigo y su microbioma

La domesticación del trigo ha generado especies con diferencias en su ploidía. Los genes Rht son responsables de producir plantas de trigo enanas y la característica de altura es controlada por más de 20 genes de éste tipo; sin embargo, los programas de mejoramiento de plantas se centran en el desarrollo de características en las…
Leer más

Impacto de variaciones en la precipitación sobre el microbioma de un roedor

El cambio climático está afectando el estilo de vida de muchas especies, lo cual puede generar un efecto dominó ya que las que sirven de alimento podrían ver afectada su distribución o producción de biomasa. En este trabajo, Guolang Li y compañía decidieron investigar el efecto del cambio en precipitación en la composición de los…
Leer más

Selección de microbiota benéfica basada en el fenotipo del hospedero

En el presente trabajo se aborda el estudio de la microbiota de raíz utilizando una técnica “hospedero-céntrica”. Dicho enfoque les permitió a los autores seleccionar comunidades de microorganismos que mejoraran la tolerancia de plántulas de trigo ante la sequía, con base en el monitoreo del fenotipo de las plantas, a lo largo de varias inoculaciones.…
Leer más

Los micobiomas de raíces de plantas locales y plantas fitómeras son equiparables en pastizales gestionados

Se denominan plantas locales a aquellas plantas que se establecieron sin intervención antropogénica en el campo a partir de semillas del pool local. Estas plantas tienen acceso a los microorganismos del suelo de pastizales desde el momento de su germinación. Por el contrario, las fitómeras son individuos trasplantados después de ser germinados y cultivados bajo…
Leer más

Comunidad microbiana de relaves mineros de cuencas de Tungsteno, perfil y predicción de su función.

Ana Paula Chung es una investigadora portugueña que trabaja en el centro de investigación en biodiversidad y recursos genéticos en Portugal. En este trabajo, ella y sus colaboradores plantean que el estudio de los consorcios microbianos que habitan en los desechos mineros de Tungsteno (W) en Panasqueira, Portugal, permitirá proponer soluciones alternas para la extracción…
Leer más