Autor: Luis David Alcaraz

Reseña segunda parte del libro

Estimados, para complementar sus evaluaciones tienen hasta el 3 de junio a las 11:59 p.m. para completar esta evaluación. Pueden contestar en el siguiente vínculo: https://docs.google.com/forms/d/e/1FAIpQLSeWltZltcH_dnWewgZNGvnDnIrL6Iwqm2dXZEDxr4SFTtJYIw/viewform?usp=sf_link O aquí mismo en la página:   Cargando…  

Tarea 5 Biotecnología

La siguiente parte se entrega a mano el lunes 8 de mayo en la clase, por equipos de laboratorio: Ejercicio 1 El siguiente es el esquema del plasmido 31416 (p31416): Las enzimas de restricción que cortan el vector se muestran a continuación, no hay ningún otro sitio de corte en el vector: Un gen W…
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Control de lectura biotecnología

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Planta y suelo afectan al ensamblado de la comunidad de bacterias

En este trabajo Reese y colaboradores plantean un experimento de mesocosmos en un gradiente latitudinal amplio, que son 7 puntos desde el norte de Estados Unidos (Syracuse), hasta el sur por la costa este (Florida). Adicional a las condiciones latitudinales se hacen múltiples manipulaciones del suelo inicial, asì como múltiples tratamientos de la vegetación a crecer. Las manipulaciones…
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¿Heredabilidad del microbioma?

En genética clásica existen índices como el de heredabilidad. La heredabilidad, en un sentido clásico es medir el nivel de variación en rasgos fenotípicos en una población que se debe a variación genética.  Osea, la variación explicada por genética, no el azar o factores ambientales. Está imagen es fantástica para explicar la heredabilidad:   En…
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Tarea 3

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Tarea 2 Biotecnología 1

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Biotecnología 1. Tarea 1.

Estimados, Por aquí van a tener que revisar y contestar casi todas las actividades del semestre. En esta ocasión les pido que hagan un control de lectura (máximo 1 cuartilla) de las siguientes páginas web:   http://elcomidista.elpais.com/elcomidista/2016/08/31/articulo/1472625105_953819.html http://elcomidista.elpais.com/elcomidista/2014/01/30/articulo/1391061600_139106.html   Las entradas del curso pueden ser revisadas bajo la etiqueta: https://genomica.fciencias.unam.mx/?cat=129 Que se encuentra en la…
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Secuenciando DNA a lo gigante con Nanoporos

Hace tiempo que me gustaría tener uno de estos aparatejos. En la carrera de secuenciación masiva de DNA la secuenciación mediante nanoporos ha sido un anhelo, comenzó casi como mito y anunciado con mucha premura, luego lo hicieron disponible a centros de secuenciación establecidos y ahora está a la venta libre. Los nanoporos son una…
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Curso de biología molecular posgrado

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PREPARADOs para lo nuevo en genómica de bacterias asociadas a plantas

PREPARADOs es otro acrónimo que se agrega a la lista (interminable de acrónimos). Es el nombre corto de plant-resembling plant-associated and root-associated domains (dominios relacionados y asociados a plantas y raíces). El acrónimo me recuerda a una cerveza malísima, en Europa dicen que es mexicana: DESPERADOS   El artículo está bueno, no como la cerveza.…
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Anotación con M5NR

Actividades:   Leer el artículo del M5NR Descargar el archivo con los archivos de esta clase La base de datos de anotación es el archivo clase.fasta que es una versión local del M5NR Utilizar el proteoma de Agrobacterium H13 Sigue las siguientes instrucciones Cargando…   Prueba hacer un heatmap con las funciones recien anotadas:  …
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Bioinformática predicción de genes no codificantes 2 de octubre 2017

Predicción de genes no codificantes: 1. Descarga el código fuente de tRNAScanSE: wget http://lowelab.ucsc.edu/software/tRNAscan-SE.tar.gz , el artículo lo puedes consultar en: http://nar.oxfordjournals.org/content/25/5/0955.abstract?sid=c28dd9c3-943e-44d4-99fe-15ee8a5ac051 2. Descomprime el archivo 3. Entra al directorio de tRNAscan-SE 4. Ejecuta un ls -lh y guarda la salida a un archivo 5. Ejecuta el comando make 6. Ejecuta el comando make install…
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2017-2 Biotecnología Tarea 4 (Transcripción)

Hola, tienes hasta el 21 de marzo (8 p.m.) para contestar la tarea. Loading…