Autor: Luis David Alcaraz

Calificaciones 3er parcial Biotecnología 1

Si quieres revisar tu examen ven al Instituto de Ecología el día viernes 29 de noviembre de 1:30 – 2:30 p.m. Para reposiciones, son el día martes 2 de diciembre, sólo se puede presentar 1 reposición y se renuncia a la calificación anterior. Si quedas más bajo, esa calificación se queda. Por favor indicar que…
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Tarea 8: Blast (Fecha límite de entrega: 27 de Octubre)

Es necesario que hayas tomado notas en la clase y además te recomiendo revisar los siguientes enlaces: http://es.wikipedia.org/wiki/BLAST http://en.wikipedia.org/wiki/BLAST http://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK1734/#blast.fn5 http://www.ncbi.nlm.nih.gov/BLAST/tutorial/ Tarea: ¿Qué es el NCBI? ¿Qué es Genbank? ¿Qué es Pubmed? De lo que leiste de BLAST ¿Qué es un HSP? ¿Qué es el e-value? ¿Qué es un P-value? ¿Qué es un gap? ¿Qué…
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Temario Examen 2 martes 29 octubre 2013

Herramientas de la ingeniería genética Definición de la ingeniería genética Enzimas como herramientas para la ingeniería genética Endonucleasas tipo I y II Polinucleótido quinasa Ligasas de DNA Polimerasas de DNA Transcriptasa reversa Desoxinucleotidil transferasa terminal Poli-A polimerasa Vectores Sistemas de vectores en procariontes y anfitriones Sistemas basados en Escherichia coli Vectores plasmídicos de E. coli…
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Tarea 7. Biología Sintética

Por favor, observa los siguientes videos: Ahora, escribe un breve ensayo (máximo 1 cuartilla), en el que resumas que se hizo para generar a la bacteria sintética. Si necesitas información extra puedes revisar los siguientes vínculos: http://en.wikipedia.org/wiki/Mycoplasma_laboratorium La noticia en la revista Science: http://www.sciencemag.org/content/328/5981/958.full El artículo de investigación en Science: http://www.sciencemag.org/content/329/5987/52 Además de la cuartilla …
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Tarea 6. Enzimas de restricción y clonación

La tarea la puedes descargar de la siguiente liga: https://copy.com/JoAZWANb649q Las respuestas se reciben como comentarios en esta entrada. Se tiene que entregar a más tardar el 28 de septiembre.

Tutorial Básico de UNIX/Linux

Si comienzas a trabajar en análisis de genes/genomas en nuestro grupo necesitas tener conocimientos básicos de como interactuar con el sistema operativo UNIX/Linux. A continuación algunos tutoriales: http://www.ee.surrey.ac.uk/Teaching/Unix/

Calificaciones Examen 1

# de Cuenta    Calificación 412061323    10 307046712    8 307046925    10 308049716    5 305006020    6 308023378    9 306534762    np 308001914    5 308037812    8 307174862    8 301089535    7 308173727    9 308280032    5 307171012    7 307232777    9 308287529    np 308127768    7 411017334    np 308232945    9 409065617    7 309601043    9

Tutorial básico de scripting en shell

En este sitio hay un tutorial de scripting en shell que les puede ser de utilidad: http://www.freeos.com/guides/lsst/ Aquí esta el sitio, pero de preferencia usen el link de arriba!

Tarea 5. De la proteína al gen!

La siguiente es la secuencia del gen groS, un gen favorito como cualquier otro:   Tenemos que una cadena es: 5′-atttctctggtcaccagccgggaaaccacgtaagctccggcgtcacccataacagatacg gactttctcaaaggagagttatcaatgaatattcgtccattgcatgatcgcgtgatcgtc aagcgtaaagaagttgaaactaaatctgctggcggcatcgttctgaccggctctgcagcg gctaaatccacccgcggcgaagtgctggctgtcggcaatggccgtatccttgaaaatggc gaagtgaagccgctggatgtgaaagttggcgacatcgttattttcaacgatggctacggt gtgaaatctgagaagatcgacaatgaagaagtgttgatcatgtccgaaagcgacattctg gcaattgttgaagcgtaatccgcgcacgacactgaacatacgaatttaaggaataaagat aatggcagctaaagacgtaaaattcggtaacgacgctcgtgt-3′   La cadena complementaria:   3′-taaagagaccagtggtcggccctttggtgcattcgaggccgcagtgggtattgtctatgc ctgaaagagtttcctctcaatagttacttataagcaggtaacgtactagcgcactagcag ttcgcatttcttcaactttgatttagacgaccgccgtagcaagactggccgagacgtcgc cgatttaggtgggcgccgcttcacgaccgacagccgttaccggcataggaacttttaccg cttcacttcggcgacctacactttcaaccgctgtagcaataaaagttgctaccgatgcca cactttagactcttctagctgttacttcttcacaactagtacaggctttcgctgtaagac cgttaacaacttcgcattaggcgcgtgctgtgacttgtatgcttaaattccttatttcta ttaccgtcgatttctgcattttaagccattgctgcgagcaca-5′   La secuencia de aminoácidos para la que codifica el gen es la siguiente:…
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Traducción

Vean estos dos videos complementando lo que vimos en clase, primero uno «serio»: Luego revisen este, lo que hacia la gente antes de poder hacer animaciones: Como dato curioso: Directed in 1971 by Robert Alan Weiss for the Department of Chemistry of Stanford University and imprinted with the «free love» aura of the period, this…
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Tarea 4. ENCODE

Ve estos videos: Después revisa esta página: http://www.nature.com/encode/ Contesta, de forma breve: 1. ¿Qué es el proyecto ENCODE? 2. Explica la siguiente figura, en tus palabras:

Tarea 3. Transcripción

  En base a lo que revisamos en clase y a lo que aparece en este capítulo http://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK26887/  o en tu libro favorito de biología molecular por favor indica al menos 3 omisiones que hace el video.   Además haz una lista con los pasos, enzimas, moléculas necesarias para pasar de una secuencia de DNA…
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Tarea 2.

Hacer una narración de que elementos se muestran en el vídeo, de acuerdo a lo que vimos en clase y lo que investigues por tu cuenta sobre el proceso de replicación. Resalta que elementos no se encuentran o se encuentran simplificados en el vídeo. Fecha límite de entrega: Martes 19 de agosto de 2013

Tarea 1. Para entregar el 13/08/2013

Enumera  qué instituciones en México regulan la biotecnología. Describe con tus palabras, después de investigar, qué es el golden rice, como y quién desarrolló que implicaciones piensas que tenga en los campos de salud, ambiente, economía y ética. No más de una 500 palabras. Para dejar la respuesta a esta tarea tienen que ingresar a…
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Curso 2014-1. Biotecnología 1. Facultad de Ciencias. Grupo 5382

La información general del curso puede ser consultada en el siguiente vínculo: http://web.ecologia.unam.mx/laboratorios/genomica/?page_id=655