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Nuestra nueva publicación: El microbioma de Marchantia como modelo para entender los microbiomas basales de las plantas

29 enero, 2017

Nuestra nueva publicación en bioRXiv, que es un preprint server. El trabajo se encuentra sometido a revisión por pares en este momento. Marchantia liverworts as a proxy to plants basal microbiomes. Luis David Alcaraz, Mariana Peimbert, Ana E. Dorantes-Acosta, John L. Bowman, Mario A. Arteaga-Vazquez bioRxiv 103861; doi: https://doi.org/10.1101/1038613 http://biorxiv.org/content/early/2017/01/28/103861

El precio de tener pares de bases sintéticos

24 enero, 2017

Zhang y compañía continúan en su búsqueda para diseñar un organismo viable que contenga pares de bases sintéticos (PBSs). Estos pares X-Y están compuestos por dNaM-d5SICS o dNaM-dTPT3, los cuales no forman puentes de hidrógeno (como los pares A-T o G-C) sino que se asocian por interacciones hidrofóbicas. En una publicación previa se reportó la…
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Componentes patogénicos al rescate. El sistema de secreción tipo 6 de P. putida confiere protección contra fitopatógenos.

19 enero, 2017

Este trabajo muestra la amplia distribución del sistema de secreción tipo 6 (T6SS) en diferentes especies y cepas de Pseudomonas. Este sistema es encargado de inyectar efectores tóxicos en células blanco. Al analizar el genoma de la cepa KT2440, se encontró que contiene tres clusters de T6SS; uno de los cuales es responsable de la…
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Tres nuevos bacteriofagos de E. coli muestran potencial en la fagoterapia

1 diciembre, 2016

En este estudio publicado en 2016 en Plos One, identifican 3 bacteriofagos promisorios para tratar a ciertas cepas patogénicas de E. coli. Los bacteriofagos son virus capaces de infectar a bacterias, multiplicarse en su interior y lisarla (virus míticos). Tienen la característica de ser altamente específicos en su infección incluso a nivel de variedades a…
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La unión hace la fuerza. El quorum sensing es responsable de mediar los mecanismos inmunes bacterianas

1 diciembre, 2016

Las bacterias cuentan con un sistema inmune en contra de DNA exógeno; CRISPR-Cas. En este trabajo se observó que los procesos de quorum sensing están involucrados en la respuesta de CRISPR-Cas. Al encontrarse en alta densidad celular y fase exponencial, P. aeruginosa muestra el nivel de expresión mas alto de cas3, lo cual promueve la…
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Calificaciones Biotecnología 1 (Teoría)

30 noviembre, 2016

Estimad@s tod@s, Aquí las calificaciones hasta el momento del curso de biotecnología. Estas calificaciones son para la parte de teoría (biología), son la calificación de mi sección (cs. de la tierra). La calificación final del curso estará publicada en este sitio a finales de la próxima semana con la calificación del laboratorio (biología). Para…
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Examen de reposición 2017-1 Biotecnología

24 noviembre, 2016

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Trabajo final de Biotecnología (2017-1)

21 noviembre, 2016

Reglas: Se debe de hacer un ensayo sobre alguno de los siguientes temas: Edición de genomas Terapia génica Biotecnología agrícola Biotecnología industrial Genómica Biología sintética Desarrollo de vacunas Se hace por equipos de 2-3 personas, no se aceptan trabajos individuales. Se debe de hacer bajo la siguiente estructura: Introducción sobre el problema debidamente fundamentada y referenciada…
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2017-1 Biotecnologia última tarea

15 noviembre, 2016

Hacer un control de lectura y tu opinión de las siguientes lecturas: http://elpaissemanal.elpais.com/documentos/transgenicos/ http://elpais.com/elpais/2016/06/30/ciencia/1467286843_458675.html Con la información de la clase haz un control de lectura y emite tu opinión (libremente) de lo que opinas de los riesgos/beneficios de la biotecnología agrícola. ¿Cambió tu percepción de esto en el curso? Loading…

Buscando patrones de evolución genómica en arqueas

12 noviembre, 2016

Wolf y compañía evaluaron un modelo de evolución genómica basándose en un conjunto de principios dados por comparaciones de genomas procariontes: 1- existe un número muy reducido de genes universales, 2- del 10 al 30% de los genes en la mayoría de los genomas microbianos son ORFan (presentes en pocas especies emparentadas), 3- los genes…
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Relación entre la distancia genética de plantas hospederas y su microbioma de rizósfera

11 noviembre, 2016

Hospederos de un mismo grupo taxonómico comparten características que pueden determinar la selección de microorganismos asociados al condicionar las propiedades como la superficie de colonización, disponibilidad de carbono y fuentes de energía o la exposición a mecanismos de defensa y metabolitos secundarios. La hipótesis de este trabajo es que la historia evolutiva de hospederos puede…
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Anotación funcional genómica rápida a través de asignación de ortología con eggNOG-mapper

10 noviembre, 2016

La identificación de los genes originados por especiación, conocidos como genes ortólogos, es una pregunta central en biología evolutiva. La teoría dice que la retención de funciones ancestrales es más probable entre genes ortólogos que entre parálogos. En este artículo, Huerta-Cepas et al. Describen una herramienta que utiliza la base de datos de ortólogos ‘eggNOG’…
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Comunidades microbianas artificiales contra la invasión de patógenos

9 noviembre, 2016

Este trabajo utiliza experimentos de microcosmos y de jardín común para analizar el efecto que tienen las comunidades previamente establecidas en un hospedero ante la llegada de un patógeno. Con éste fin, se utilizaron cinco bacterias del género Ralstonia sin capacidad infectiva, establecidas en placas microtituladoras y raíz de tomate, que posteriormente fueron sujetas a…
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Transferencia horizontal y resistencia a antibióticos

7 noviembre, 2016

2017-1 Biotecnología Control de lectura DNA diet