Funciones representadas en comunidades microbianas de drenaje ácido de mina
Se tomaron muestras de drenaje ácido de mina de tres sitios (DBS, FK, YFS-P) dentro de la provincia de Guangdong, China. Todos los sitios se caracterizaron por valores muy bajos de pH y carbono orgánico y concentraciones altas de sulfato, hierro y metales pesados; sin embargo cada uno presentó ciertas características fisicoquímicas únicas. Se obtuvieron…
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Fur, hierro, patogénesis y polisacáridos
El hierro es clave en procesos de colonización de los microorganismos, es un nutriente esencial en la vida, con múltiples usos en la célula desde cofactor hasta el transporte de electrones. Además, tiene roles en la patogénesis y virulencia. En las interacciones entre hospedero y sus microbios en la mayoría de las ocasiones existe competencia…
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Bacteria del intestino humano es sensible a la melatonina y expresa ritmo circadiano propio.
Este estudio publicado en enero de 2016, por primera vez demuestran la existencia de reloj biológico en procariota fuera del filum Cyanobacteria. Para esto aislaron Enterobacter aerogenes (E.a), un comensal de la microbiota intestinal y lo cultivan a diferentes concentraciones de melatonina, observando que su mejor crecimiento está en concentraciones similares a las del intestino…
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Simbiosis planta-bacteria con capacidad antifúngica
Fusarium gramineareum es un hongo patógeno de varias especies de gramíneas como el maíz y el trigo. En este trabajo se estudia el caso del cereal conocido como mijo africano (Eleusine coracana), el cual establece simbiosis con un endófito de raíz del genero Enterobacter (nombrado M6) que le confiere resistencia contra Fisarium. El mecanismo de…
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Estrategias r y K en comunidades bacterianas de suelo
En este trabajo analizan la comunidad de bacterias del suelo en diferentes edades sucesionales, caracterizan la actividad metabólica y la riqueza de la comunidad, además de el «índice de oportunismo». Encuentran una tendencia bifásica en la actividad de las comunidades, un aumento en la riqueza y disminución de la dominancia conforme aumenta la edad sucesional,…
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Módulo de asociación eucariota en los genomas del fago WO de Wolbachia
Existen virus específicos para cada uno de los tres dominios: eucariontes, bacterias y archea. El presente estudio sugiere que los virus de bacterias intracelulares obligadas que infectan eucariontes pueden promover transferencias de DNA entre eucariontes y bacteriófagos. Bordenstein y Bordenstein hicieron un analisis metagenómicos de varias cepas del fago WO que infecta Wolbachia. Esta bacteria…
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2017-1 Biotecnología tarea control de lectura
La lectura (si das click se abre en una nueva ventana): Loading… Finalmente, los videos que vimos en clase están disponibles en el siguiente vínculo: https://drive.google.com/drive/folders/0B7dtIr9rg974cUNhSjZzTUc2b1k?usp=sharing
Comunidades microbianas de perfiles de jales mineros: Efecto de la restauración
En este trabajo se analizaron las comunidades microbianas a través del perfil (0-60 cm de profundidad) de jales mineros, haciendo una comparación entre el jal sin vegetación y dos plantas creciendo en el jal, Imperata cylindrica y Chrysopogon zizanioides. El objetivo era analizar el impacto que tiene la vegetación en las propiedades fisicoquímicas del jal…
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Autofagia (premio Nobel 2016) y bacterias
El premio Nobel de fisiología-medicina (2016) fue otorgado a Yoshinori Oshumi por sus descubrimientos en la Autofagia. En el artículo de revisión que les propongo esta semana se define a la autofagia como la vía celular que entrega proteínas citoplásmicas y organelos a los lisozomas para su degradación. Que siempre sucede a una tasa basal,…
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Cambios de precipitación estacionales modifican las comunidades bacterianas de la rizosfera
Los autores probaron la hipótesis de que la sequía tiene un efecto limitante en la diversidad taxonómica de las comunidades bacterianas asociadas a los compartimentos rizosféricos de plantas que crecen en climas semiáridos. Para ello, Taketani y compañía analizaron las rizosferas de dos plantas: Mimosa tenuiflora y Piptadenia stipulacea en cinco sitios del noreste de…
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Viroma y microbioma de pacientes sanos y con infección urinaria
En este estudio comparan el viroma y el microbioma de 10 personas con infección urinaria y 10 sanas. Para esto purificaron la fracción de virus en 1ml de orina y posteriormente los secuenciaron en un chips de 314 puestos en Ion Torrent. Se filtran las secuencias de bacterias y humanas de las de viruses. Para…
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Metatranscriptómica de suelos contaminados con metales pesados
En este trabajo, Epelde y compañía obtuvieron los metatranscriptomas de suelo de tres sitios (concentración baja, media y alta de metales pesados, respectivamente) en una mina abandonada de plomo y zinc en el norte de España. Esta técnica permite observar tanto el rRNA como el mRNA de una muestra en un momento determinado, lo cual…
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Aplicación de métodos de etiquetado estocástico con códigos de barra de secuencia aleatoria para la cuantificación y secuenciación simultánea de genes 16S rRNA ambientales
Los métodos de secuenciación de nueva generación (NGS) han permitido el estudio de las comunidades microbianas a nivel molecular. En ocasiones los investigadores requieren saber el número de copias de cierta secuencia en la muestra. Para ello se han empleado métodos cuantitativos basados en PCR (qPCR y dPCR). Sin embargo el número de secuencias obtenidas…
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Mapa en 3D del microbioma y metabolitos corporales
Este artículo publicado en 2015, presenta un método de incorporación de data de microbioma y metabolitos recogidos de la piel humana en mapas en 3D que facilita la visualización y el establecimiento de correlaciones entre ambas datas. Los sujetos de su estudio son un hombre y una mujer que han pasado 3 días sin bañarse…
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