El premio Nobel de fisiología-medicina (2016) fue otorgado a Yoshinori Oshumi por sus descubrimientos en la Autofagia. En el artículo de revisión que les propongo esta semana se define a la autofagia como la vía celular que entrega proteínas citoplásmicas y organelos a los lisozomas para su degradación. Que siempre sucede a una tasa basal,…
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Los autores probaron la hipótesis de que la sequía tiene un efecto limitante en la diversidad taxonómica de las comunidades bacterianas asociadas a los compartimentos rizosféricos de plantas que crecen en climas semiáridos. Para ello, Taketani y compañía analizaron las rizosferas de dos plantas: Mimosa tenuiflora y Piptadenia stipulacea en cinco sitios del noreste de…
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En este estudio comparan el viroma y el microbioma de 10 personas con infección urinaria y 10 sanas. Para esto purificaron la fracción de virus en 1ml de orina y posteriormente los secuenciaron en un chips de 314 puestos en Ion Torrent. Se filtran las secuencias de bacterias y humanas de las de viruses. Para…
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En este trabajo, Epelde y compañía obtuvieron los metatranscriptomas de suelo de tres sitios (concentración baja, media y alta de metales pesados, respectivamente) en una mina abandonada de plomo y zinc en el norte de España. Esta técnica permite observar tanto el rRNA como el mRNA de una muestra en un momento determinado, lo cual…
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Los métodos de secuenciación de nueva generación (NGS) han permitido el estudio de las comunidades microbianas a nivel molecular. En ocasiones los investigadores requieren saber el número de copias de cierta secuencia en la muestra. Para ello se han empleado métodos cuantitativos basados en PCR (qPCR y dPCR). Sin embargo el número de secuencias obtenidas…
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Este artículo publicado en 2015, presenta un método de incorporación de data de microbioma y metabolitos recogidos de la piel humana en mapas en 3D que facilita la visualización y el establecimiento de correlaciones entre ambas datas. Los sujetos de su estudio son un hombre y una mujer que han pasado 3 días sin bañarse…
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En este artículo caracterizan el microbioma de una planta halotolerante Suaeda salsa y analizan su microbioma tanto por secuenciación del gen 16S rRNA, como de ITS para hongos. Se explora la hipótesis de que hay un microbioma seleccionado por parte de la planta en la condición de alta salinidad. En este artículo toman algunos de los…
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Existen diversos estudios que han caracterizado la microbiota del tracto vaginal. En estos se ha encontrado, que para mantener la salud del tracto genital femenino es importante que exista una baja diversidad bacteriana y que predominen especies del género Lactobacillus. Sin embargo, se desconoce a nivel funcional como es que estas comunidades bacterianas mantienen el…
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En general, el microbioma vaginal de las mujeres sanas está dominado por Lactobacillus sp. Se ha reportado que la presencia de Lactobacillus crispatus disminuye 5 veces la probabilidad de presentar vaginosis bacteriana (BV), un estado de alta diversidad bacteriana con sintomatología. Este estudio busca identificar las cepas de Lactobacillus crispatus presentes en las mujeres sanas…
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S. aureus es una bacteria comensal en el humano que puede ser un factor de riesgo en infecciones invasivas en hospitales; la nariz es el microhábitat preferido de esta bacteria. Aunque se ha observado que la microbiota de la nariz es similar al de la piel, la mayoría de los estudios existentes sobre la microbiota…
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En esta ocasión se entrega a mano para el martes 27 de septiembre, por equipos el siguiente ejercicio:
El presente trabajo busca analizar el efecto que tiene la inoculación del suelo en el establecimiento de las comunidades vegetales durante el proceso de sucesión ecológica. Para realizar el estudio, se utilizó un campo de cultivo de más de 60 años de antigüedad, que se dividió en parcelas a las que se les arrancó la…
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Este trabajo tuvo por objetivo estudiar la interacción mutualista entre dos levaduras en un sistema sintrófico donde cada cepa suplementaba un aminoácido esencial a la otra. Se realizaron monocultivos y co-cultivos de las cepas las cuales se marcaron con RFP (Leu-) y YFP (Trp-). Después de 24 horas de crecimiento se realizaba una dilución 1/10,…
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