CRISPR (edición genómica) ¿Cualquiera puede hacerlo?
Un reportero de Science trata de hacer CRISPR, ya que alguien le había dicho que cualquier idiota podía. Los resultados dan risa. La nota completa El video:
Un reportero de Science trata de hacer CRISPR, ya que alguien le había dicho que cualquier idiota podía. Los resultados dan risa. La nota completa El video:
Revisen este video donde Bonnie Bassler explica de forma sencilla la comunicación y coordinación entre bacterias, el quorum sensing
En esta era de metagenomas resulta común usar de argumento que las características fenotípicas, como la forma, en bacterias no nos lleva muy lejos debido a que se pueden tener falsos positivos de identificación de microorganismos. En el artículo que les propongo revisar esta semana mencionan ejemplos de esto: For example, the Betaproteobacteria Rhodocyclus tenuis…
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La interleucina 22 (IL-22) es importante para la regeneración del tejido y el mantenimiento de la piel y la barrera mucosa (intestino). Una de las funciones de IL-22 es el secuestro del sideróforo enteroquelina (por el péptido lipocalina-2), zinc y/o manganeso (por la proteína quelante calprotectina); esto evita el crecimiento de microorganismos patógenos en la…
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El objetivo de este articulo fue obtenet el contenido de metales totales, o metaloma, de Pseudomonas aeruginosa PAO1 para observar las diferencias en el mismo en medios de crecimiento ricos en nutrientes (LB) y restringidos de nutrientes (medio de succinato y CCA). Esta cepa produce dos sideróforos (principalmente), piroverdina (PVD) y pioquelina (PCH). Debido a…
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Este artículo publicado en 2015, presenta un método de incorporación de data de microbioma y metabolitos recogidos de la piel humana en mapas en 3D que facilita la visualización y el establecimiento de correlaciones entre ambas datas. Los sujetos de su estudio son un hombre y una mujer que han pasado 3 días sin bañarse…
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Existen diversos estudios que han caracterizado la microbiota del tracto vaginal. En estos se ha encontrado, que para mantener la salud del tracto genital femenino es importante que exista una baja diversidad bacteriana y que predominen especies del género Lactobacillus. Sin embargo, se desconoce a nivel funcional como es que estas comunidades bacterianas mantienen el…
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Este artículo realiza un análisis intregral del microbioma y metaboloma a fin de identificar especies indicadoras de bacterias intestinales asociadas con los niveles de colesterol y coprostanol en pacientes con infección de Clostridium difficile (CDI). Esta infección se caracteriza por el desequilibrio del microbioma intestinal y del metaboloma fecal. Se conoce que altas concentraciones de…
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En este artículo se evalúan las variaciones que ocurren en el perfil metabólico (respiración y actividad enzimática) y la composición de las comunidades bacterianas presentes en la rizósfera de maíz cultivado en tres tipos de suelos tratados con distintos fertilizantes; encontrándose que las comunidades bacterianas eran similares entre sitios y que las variaciones de las…
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Our new paper available as preprint: Cockatiel gut microbiomes http://ift.tt/29J6rq1 via @PeerJPreprints snapshot1.png
Distinguiendo entre enemigos y amigos: Dissecting endophytic lifestyle along the parasitism/mutualism continuum in Arabidopsis Es un artículo de opinión con algunos datos de lo que discutíamos la semana pasada. ¿Cómo distinguir entre simbiontes y patógenos? En el contexto de microorganismos que viven en el compartimento endofítico. 1. Fesel, P. H. & Zuccaro, A. Dissecting endophytic…
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El uso de proteínas fluorescentes para marcar células no sólo prometía ser importante como marcador de selección, ha sudo de gran utilidad para visualizar y monitorear bacterias en su ambiente. Comunmente se han usado plásmidos con la proteína fluorescente expresada de forma constitutiva, sin embargo, el problema con esta metodología es que para preservar al…
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En el libro Field Guidelines for Genetic Experimental Designs in High-Throughput Sequencing http://www.springer.com/gp/book/9783319313481