Medicago truncatula es una leguminosa que forma nódulos para la fijación de nitrógeno al establecer simbiosis con Sinorhizobium meliloti. Para conocer el proteínas que podrían estar implicadas en la simbiosis, se utilizaron técnicas de espectrometría de masas de alta resolución, para estudiar el meristemo apical, flor, hojas, tallo, raíz y nódulos (de 10, 14 y…
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A través de sus exudados la planta recluta microorganismos del suelo, estos pueden ser una fuente de carbón o moléculas de señalizacion. Por medio de la técnica de DNA/RNA-SIP se pueden utilizar isótopos marcados para conocer los flujos de elementos (C, P o N) en la rizósfera. Por ejemplo, 13CO2 se utiliza como sustrato, es…
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Se tomaron muestras de drenaje ácido de mina de tres sitios (DBS, FK, YFS-P) dentro de la provincia de Guangdong, China. Todos los sitios se caracterizaron por valores muy bajos de pH y carbono orgánico y concentraciones altas de sulfato, hierro y metales pesados; sin embargo cada uno presentó ciertas características fisicoquímicas únicas. Se obtuvieron…
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El hierro es clave en procesos de colonización de los microorganismos, es un nutriente esencial en la vida, con múltiples usos en la célula desde cofactor hasta el transporte de electrones. Además, tiene roles en la patogénesis y virulencia. En las interacciones entre hospedero y sus microbios en la mayoría de las ocasiones existe competencia…
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Este estudio publicado en enero de 2016, por primera vez demuestran la existencia de reloj biológico en procariota fuera del filum Cyanobacteria. Para esto aislaron Enterobacter aerogenes (E.a), un comensal de la microbiota intestinal y lo cultivan a diferentes concentraciones de melatonina, observando que su mejor crecimiento está en concentraciones similares a las del intestino…
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Fusarium gramineareum es un hongo patógeno de varias especies de gramíneas como el maíz y el trigo. En este trabajo se estudia el caso del cereal conocido como mijo africano (Eleusine coracana), el cual establece simbiosis con un endófito de raíz del genero Enterobacter (nombrado M6) que le confiere resistencia contra Fisarium. El mecanismo de…
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En este trabajo analizan la comunidad de bacterias del suelo en diferentes edades sucesionales, caracterizan la actividad metabólica y la riqueza de la comunidad, además de el «índice de oportunismo». Encuentran una tendencia bifásica en la actividad de las comunidades, un aumento en la riqueza y disminución de la dominancia conforme aumenta la edad sucesional,…
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Existen virus específicos para cada uno de los tres dominios: eucariontes, bacterias y archea. El presente estudio sugiere que los virus de bacterias intracelulares obligadas que infectan eucariontes pueden promover transferencias de DNA entre eucariontes y bacteriófagos. Bordenstein y Bordenstein hicieron un analisis metagenómicos de varias cepas del fago WO que infecta Wolbachia. Esta bacteria…
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En este trabajo se analizaron las comunidades microbianas a través del perfil (0-60 cm de profundidad) de jales mineros, haciendo una comparación entre el jal sin vegetación y dos plantas creciendo en el jal, Imperata cylindrica y Chrysopogon zizanioides. El objetivo era analizar el impacto que tiene la vegetación en las propiedades fisicoquímicas del jal…
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El premio Nobel de fisiología-medicina (2016) fue otorgado a Yoshinori Oshumi por sus descubrimientos en la Autofagia. En el artículo de revisión que les propongo esta semana se define a la autofagia como la vía celular que entrega proteínas citoplásmicas y organelos a los lisozomas para su degradación. Que siempre sucede a una tasa basal,…
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Los autores probaron la hipótesis de que la sequía tiene un efecto limitante en la diversidad taxonómica de las comunidades bacterianas asociadas a los compartimentos rizosféricos de plantas que crecen en climas semiáridos. Para ello, Taketani y compañía analizaron las rizosferas de dos plantas: Mimosa tenuiflora y Piptadenia stipulacea en cinco sitios del noreste de…
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En este estudio comparan el viroma y el microbioma de 10 personas con infección urinaria y 10 sanas. Para esto purificaron la fracción de virus en 1ml de orina y posteriormente los secuenciaron en un chips de 314 puestos en Ion Torrent. Se filtran las secuencias de bacterias y humanas de las de viruses. Para…
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En este trabajo, Epelde y compañía obtuvieron los metatranscriptomas de suelo de tres sitios (concentración baja, media y alta de metales pesados, respectivamente) en una mina abandonada de plomo y zinc en el norte de España. Esta técnica permite observar tanto el rRNA como el mRNA de una muestra en un momento determinado, lo cual…
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Los métodos de secuenciación de nueva generación (NGS) han permitido el estudio de las comunidades microbianas a nivel molecular. En ocasiones los investigadores requieren saber el número de copias de cierta secuencia en la muestra. Para ello se han empleado métodos cuantitativos basados en PCR (qPCR y dPCR). Sin embargo el número de secuencias obtenidas…
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En este artículo caracterizan el microbioma de una planta halotolerante Suaeda salsa y analizan su microbioma tanto por secuenciación del gen 16S rRNA, como de ITS para hongos. Se explora la hipótesis de que hay un microbioma seleccionado por parte de la planta en la condición de alta salinidad. En este artículo toman algunos de los…
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