Gracias a la secuenciación y anotación genómica, en la actualidad es posible conocer los genes presentes en cada organismo y en consecuencia, las posibles reacciones químicas que se pueden encontrar en el genoma. Estas reacciones, por medio de sus sustratos y productos, revelan el perfil metabolómico del organismo en cuestión y a partir de esta…
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Se sabe que la composición de microorganismos en el intestino, principalmente respecto a bacterias, ocurre inmediatamente después del nacimiento y va madurando y cambiando a través del tiempo debido a diversos factores como hábitos alimenticios o incluso uso de antibióticos. No obstante, el microbioma, el microbioma también incluye a hongos, arqueas, virus y bacteriófagos, y…
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En este trabajo los autores estudiaron las diferencias en el microbioma de la hormiga Cephalotes rohweri en cada una de sus estructuras intestinales ademas del efecto del proventrículo y las bacterias asociadas a este en la transmisión de microorganismos del buche al intestino. Para esto se diseccionaron diferentes ejemplares separando con minuciosidad las estructuras intestinales…
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Una de las características de las tundras árticas es la formación de estructuras poligonales de diferentes tipos en la superficie del suelo: los de centro bajo (LCP), centro plano (FCP) y centro elevado (HCP). Por otro lado, en el eje vertical existe una capa activa (que a su vez se puede dividir en orgánica y…
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Existe una gran inquietud por lograr describir por completo la diversidad bacteriana. Para ello, una amplia gama de características fenotípicas y moleculares han sido utilizadas para clasificarlas dentro de distintas especies, entre ellas, la identidad entre secuencias del gen de rRNA 16S ha sido ampliamente adoptado para definir este concepto. En este trabajo, los autores…
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El Desierto de Atacama es el desierto no polar más seco de la Tierra ya que tiene un precipitación media anual menor a 20 mm. En algunos sitios, la actividad de agua es menor a la mínima necesaria para sustentar actividad metabólica. Dadas estas condiciones, Schulze-Makuch y compañía decidieron determinar si este lugar puede mantener…
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Los microorganismos presentes en la rizósfera interactúan con la planta de forma negativa y/o positiva, por ejemplo compitiendo por nutrientes con la planta, generando enfermedad, favoreciendo el crecimiento a través de la producción de hormonas, haciendo disponibles algunos nutrientes para la planta, ect. Si embargo, resulta interesante conocer las respuestas por parte de la planta…
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En genética clásica existen índices como el de heredabilidad. La heredabilidad, en un sentido clásico es medir el nivel de variación en rasgos fenotípicos en una población que se debe a variación genética. Osea, la variación explicada por genética, no el azar o factores ambientales. Está imagen es fantástica para explicar la heredabilidad: En…
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Los autores analizaron el microbioma eucarionte y procarionte en tres especies de mosquito transmisores de enfermedades: Aedes aegypti, Ae. albopictus, y Culex quinquefas ciatus, utilizando ROCHE 454 secuenciaron librerías de 16S y 18S rRNA. Los mosquitos fueron recolectados de en diferentes hábitats en Tailandia utilizando únicamente hembras de las tres especies en lotes de 3…
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El estudio del microbioma humano, durante los primeros años, principalmente se enfocó a la identificación, abundancia y diversidad de los microorganismos, principalmente bacterias. Así pues, no transcurrió mucho tiempo para que varios estudios comenzaran a correlacionar la presencia de estos microorganismos con los estados de salud/enfermedad, es decir, ¿cómo es que un evento de disbiosis…
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El estudio de las interacciones planta-microorganismo conlleva, la mayoría de las veces, a que la variable de respuesta sea la misma planta. Medir el crecimiento y salud de la planta a través de parámetros como longitud, peso, número y tamaño de hojas, forma y tamaño de la raíz, cantidad de clorofila y grosor del tallo…
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Rüdiger Ortiz-Álvarez y compañía analizaron la sucesión ecológica (el cambio de las comunidades biológicas a través del tiempo) en comunidades microbianas por medio de un meta-análisis. Usando la sucesión primaria como modelo, buscaron patrones en los cambios de diversidad taxonómica y funcional en estudios en donde se tuviera información de la composición del microbioma de…
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La mayor parte de los ensayos de interacción planta-bacteria son considerados reduccionistas debido a que los experimentos realizados son en cultivos in vitro y utilizando sólamente a una aislado bacteriano, probando diferentes respuestas por parte de las plantas. En este trabajo Herrera Paredes y colaboradores llevan a cabo un esfuerzo para disectar las relaciones entre…
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Para comprender la actividad de los microbios a lo largo de las características heterógeneas que existen en el suelo, se utilizó un modelo elegante y simplificado que analiza la distribución de dos especies de bacterias a lo largo de gradientes de carbono y oxígeno. El modelo consiste en una placa de vidrio rectangular que contiene…
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